همچنین ایشان مدرس دوره های آمادگی دستیاری طب سنتی ایرانی وزارت بهداشت از سال 1387 و مسئول و ناظر آموزشی دوره های مقدماتی و پیشرفته طب سنتی ایرانی شرکت باریج اسانس ( برگزار کننده دوره های تخصصی طب سنتی وزارت بهداشت و درمان ) و عضو اصلی کانون هم اندیشی طب سنتی دانشگاه علوم پزشکی اصفهان از سال 1388 می باشند.

دکتر مجتبی معتمدی همچنین عضو هئیت برگزاری همایش کشوری طب سنتی ایرانی دانشگاه علوم پزشکی اصفهان
،مدرس کارگاه های تخصصی مزاج شناسی دانشگاه های اصفهان ، خرم آباد و مازندران و مدرس دوره های طب سنتی ایرانی انجمن آموزش پزشکی کشور می باشند.

دکتر مجتبی معتمدی عضو شورای راهبردی طب سنتی کشور می باشند.

ایشان محقق ، مدرس و درمانگر طب سنتی از سال 1383 تاکنون و مدرس طب سنتی دانشگاه آزاد اصفهان- خوراسگان از سال 1392 تاکنون می باشند.

دکتر مجتبی معتمدی مدیر مرکز درمان سبز، مجموعه درمان های طبیعی از سال 1384 تاکنون هستند.

از افتخارات ایشان اخذ مدارک متعدد دوره های طب سنتی ایرانی در کارگاه ها و دوره های تخصصی دانشگاه های مختلف کشور و کسب مدرک دوره تخصصی آموزشی طب سنتی ایرانی مصوب وزارت بهداشت درمان و آموزشی پزشکی و انجمن علمی طب سنتی کشور می باشد.